Depuis 1998, la FNEGE récompense chaque année les meilleures recherches doctorales. Un prix est attribué dans chaque discipline (Comptabilité / Contrôle de gestion, Finance, Gestion desRessources Humaines, Marketing, Management stratégique, Systèmes d'information,Entrepreneuriat). Chaque lauréat reçoit un chèque de 1 000 euros.

Parmi les sept lauréats (un par discipline), la FNEGE attribue ensuite un prix de publication. La thèse primée est publiée par les éditions Vuibert. Remarque : La FNEGE attribue par ailleurs un prix pour la meilleure thèse transversale. Ce prix n'est pas géré par l'Association Française du Marketing.

1997 : Pierre VOLLE
1998 : Sandrine MACE
1999 : Véronique PLICHON
2000 : Dominique CRIE
2001 : Anne KRUPICKA
2002 : Lars MEYER-WAARDEN
2003 : Juliette PASSEBOIS
2004 : Eric LOMBARDOT
2005 : Agnès FRANCOIS-LECOMPTE et Kiane GOUDARZI ex-aequo
2006 : Caroline LANCELOT MILTGEN
2007 : Ouidade ZAARAOUI SABRI
2008 : Jeanne LALLEMENT